Çekek Nû ji bo Teşhîskirina Tuberkulozê û Tespîtkirina Berxwedana Derman: Rêzkirinek Targeted a Nifşê Nû (tNGS) Bi Fêrbûna Makîneyê re Ji bo Teşhîsa Zêde Hesasiya Tuberkulozê
Rapora wêjeyê: CCa: modelek tespîtkirinê ya ku li ser bingeha tNGS û fêrbûna makîneyê ye, ku ji bo mirovên ku bi ziravbûna bakterî ya kêmtir û meningîta tîrêjê re maqûl e.
Sernavê tezê: Rêzkirin û fêrbûna makîneyê ya nifşê din-armanc-tuberkuloz: stratejiyek tespîtkirinê ya ultra-hesas ji bo tubûlên pişikê yên pacific û meningîta tubular.
Demjimêr: 《Clinica Chimica Acta》
IF: 6.5
Dîroka weşanê: Çile 2024
Bi Zanîngeha Akademiya Zanistî ya Chineseînî û Nexweşxaneya Pekînê ya Zanîngeha Bijîşkî ya Paytextê re, Macro & Micro-Test modelek tespîtkirina tuberkulozê li ser bingeha teknolojiya nifşê nû ya rêziknameya armanckirî (tNGS) û rêbaza fêrbûna makîneyê ava kir, ku pir-bilind peyda dike. hesasiyeta tesbîtkirina ji bo zirav bi çend bakterî û meningîta tuberkulozê re, rêbazek nû ya tespîtkirina hîpersensitivity ji bo tespîtkirina klînîkî ya du celebên zirav peyda kir, û alîkariya teşhîsa rast, tespîtkirina berxwedana derman û dermankirina zirav kir.Di heman demê de, tê dîtin ku cfDNA ya plazmaya nexweş dikare wekî celebek nimûneyek maqûl ji bo nimûneya klînîkî di teşhîsa TBM de were bikar anîn.
Di vê lêkolînê de, 227 nimûneyên plazmayê û nimûneyên şilava cerebrospinal hatin bikar anîn da ku du hevrêzên klînîkî bêne saz kirin, ku tê de nimûneyên hevrêziya tespîtkirina laboratîfê ji bo damezrandina modela fêrbûna makîneyê ya teşhîsa tuberkulozê hatine bikar anîn, û nimûneyên hevrêziya klînîkî ya klînîkî ji bo verastkirina sazkirî hatine bikar anîn. modela teşhîs.Hemî nimûne yekem car ji hêla hewza lêkolînê ya girtina armanckirî ya taybetî ve hatî çêkirin ji bo Mycobacterium tuberculosis.Dûv re, li ser bingeha daneyên rêzgirtina TB-tNGS, modela dara biryarê tê bikar anîn da ku li ser komên perwerdehî û erêkirinê yên rêza tespîtkirina laboratîfê 5-qat-rast-rastkirinek pêk bîne, û bendên tespîtkirinê yên nimûneyên plazma û nimûneyên şilava cerebrospinal têne wergirtin.Rêjeya hatî bidestxistin ji bo tespîtkirinê tê nav du komên ceribandinê yên rêza tespîta klînîkî, û performansa tespîtkirinê ya xwendekar ji hêla keviya ROC ve tê nirxandin.Di dawiyê de, modela teşhîsa zirav hate bidestxistin.
Hêjîrê 1 diagrama şematîkî ya sêwirana lêkolînê
Encam: Li gorî bendên taybetî yên nimûneya DNA ya CSF (AUC = 0,974) û nimûneya cfDNA ya plazmayê (AUC = 0,908) ku di vê lêkolînê de hatine destnîşankirin, di nav 227 nimûneyan de, hestiyariya nimûneya CSF 97,01%, taybetmendî 95,65%, û hesasiyet û taybetmendiya nimûneya plazmayê %82.61 û %86.36 bû.Di analîza 44 nimûneyên cot ên cfDNA yên plazmayê û DNAya şilava cerebrospinal de ji nexweşên TBM, stratejiya tespîtkirinê ya vê lêkolînê di cfDNA-ya plazma û DNA ya şilava cerebrospinal de xwedan hevgirtinek bilind a %90.91 (40/44) e, û hestiyar 95.45% e. (42/44).Di zarokên bi ziraviya pişikê de, stratejiya tespîtkirinê ya vê lêkolînê ji nimûneyên plazmayê re ji encamên tespîtkirina Xpert ên nimûneyên ava mîdeyê yên ji heman nexweşan (28,57% VS 15,38%) hesastir e.
Xiflteya 2 Performansa analîzkirina modela tespîtkirina tuberkulozê ji bo nimûneyên nifûsê
Xiflteya 3 Encamên tespîtkirina nimûneyên hevgirtî
Encam: Di vê lêkolînê de rêbazek teşhîsa hîper-hesas ji bo tuberkulozê hate damezrandin, ku dikare ji bo nexweşên klînîkî yên bi tûberkuloza oligobacillary (çanda negatîf) amûrek tespîtkirinê ya bi hestiyariya herî bilind a tespîtkirinê peyda bike.Tespîtkirina tuberkuloza zêde hesas a li ser bingeha cfDNA ya plazmayê dibe ku celebek nimûneyek guncan be ji bo teşhîskirina tûberkuloza çalak û meningîtê zirav (nimûneyên plazmayê ji bo nexweşên ku gumana tûberkuloza mêjî heye berhevkirina ji şilava cerebrospinal hêsantir e).
Girêdana orjînal: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s0009898123004990?bi rêya%3Dihub
Danasîna kurt a hilberên tespîtkirina rêza tuberkulozê ya Macro & Micro-Test
Bi dîtina rewşa nimûneya tevlihev a nexweşên tuberkulozê û hewcedariyên cihêreng, Macro & Micro-Test komek bêkêmasî ya çareseriyên NGS ji bo derxistina şilbûnê ji nimûneyên sputumê, avakirina pirtûkxaneya Qualcomm û rêzkirin, û analîza daneyan peyda dike.Hilber teşhîsa bilez a nexweşên tuberkulozê, tespîtkirina berxwedana narkotîkê ya tuberkulozê, tîpkirina mycobacterium tuberculosis û NTM, teşhîskirina hestiyariyê ya tûberkuloza bakterî-neyînî û mirovên zirav, hwd vedigire.
Kîtên tespîtkirina rêzikan ên ji bo tuberkuloz û mîkobakteriyan:
| Jimara heyber | navê berhemê | naveroka testkirina hilberê | cureyê nimûne | modela pêkanîn |
| HWTS-3012 | Nûnerê berdana nimûneyê | Di dermankirina şilbûna nimûneyên sputumê de tê bikar anîn, jimareyek tomara pola yekem, Amûrên Makîneyên Sutong 20230047 bi dest xistiye. | sputum | |
| HWTS-NGS-P00021 | Kîta tespîtkirina mîqdarê ya Qualcomm ji bo tûberkuloza zêde hesas (rêbaza girtina sondajê) | Ne-dagirkerî (biopsiya şil) ji bo tîberkuloza pişikê ya bakterî-neyînî û girêkên mêjî;Nimûneyên mirovên ku guman tê kirin ku bi mîkobakteriya tuberkulozê an ne-tuberkulozê vegirtî ne ji hêla metagenomîkên rêzikên kûr ve hatine analîz kirin, û agahdariya tespîtkirina ka mîkobakteriya zirav an ne-tuberkuloz vegirtî ne û agahdariya sereke ya berxwedana dermanê ya yekem a mycobacterium tuberculosis. hatin pêşkêşkirin. | Xwîna periferîk, şilava şûştina alveolar, hîdrotorax û ascit, nimûneya xalîkirinê ya balkêş, şilava mêjî. | Nifşê duyemîn |
| HWTS-NGS-T001 | Tîpkirina Mycobacterium û kîta tespîtkirina berxwedana narkotîkê (rêbaza rêzgirtina zêdekirina piralî) | Testa tîpkirina Mycobacterium, tevî MTBC û 187 NTM；Tespîtkirina berxwedana narkotîkê ya Mycobacterium tuberculosis 13 derman û 16 cihên bingehîn ên mutasyonê yên genên berxwedana derman vedigire. | Sputum, şilava lavajê ya alveolar, hîdrotorax û ascît, nimûneya qulikê ya balkêş, şilava cerebrospinal. | Nifşa duyemîn / sêyemîn platforma dualî |
Nîşan: HWTS-NGS-T001 Tîpkirina Mycobacterium û kîta tespîtkirina berxwedana narkotîkê (rêbaza zêdekirina piralî)
danasîna Product
Hilber li ser bingeha dermanên sereke yên rêza yekem û duyemîn e ku di rêwerzên dermankirina TB-ê ya WHO de, makrolîd û amînoglycosîdên ku bi gelemperî di rêwerzên dermankirina NTM-yê de têne bikar anîn de têne destnîşan kirin, û cîhên berxwedana derman hemî yek grûp malperên têkildar ên berxwedana narkotîkê vedigirin. WHO kataloga mutasyona tevlihev a Mycobacterium tuberculosis, û her weha genên din ên berxwedana narkotîkê û cîhên mutasyonê yên hatine ragihandin li gorî lêkolîn û statîstîkên edebiyatên bilind ên li hundur û derveyî welêt.
Nasnameya tîpkirinê li ser bingeha cûreyên NTM-yê yên ku di rêwerzên NTM-ê de ji hêla Kovara Çînî ya Tuberkuloz û Nexweşiyên Respirasyonê ve hatine weşandin û lihevhatina pisporan ve girêdayî ye.Destpêkên tîpkirinê yên sêwirandî dikarin zêdetirî 190 cureyên NTM zêde bikin, rêz bikin û şîrove bikin.
Bi teknolojiya amplifikasyona multiplex PCR a armanckirî, genên genotyping û genên berxwedêr ên narkotîkê yên Mycobacterium ji hêla multiplex PCR ve hatin zêdekirin, û berhevoka amplikon a genên armanc ên ku bêne tespît kirin hate bidestxistin.Berhemên zêdekirî dikarin di pirtûkxaneyên rêzikan ên nifşê duyemîn an nifşê sêyemîn de werin çêkirin, û hemî platformên rêzgirtinê yên nifşê duyemîn û nifşê sêyem dikarin bi rêzgirtina kûr-bilind re bêne çêkirin da ku agahdariya rêza genên armanc bistînin.Bi berhevkirina bi mutasyonên naskirî yên ku di databasa referansê ya çêkirî de hene (di nav de kataloga mutasyona tevlihev a WHO Mycobacterium tuberculosis û pêwendiya wê bi berxwedana dermanan re), mutasyonên têkildarî berxwedana narkotîkê an hestiyariya dermanên dijî-tuberkulozê têne destnîşankirin.Digel çareseriya dermankirina nimûneya xûyê ya xwe-vekirî ya Macro & Micro-Test, pirsgirêka kêmbûna zêdekirina asîdeya nukleîk a nimûneyên kezebê yên klînîkî (deh qat ji ya rêbazên kevneşopî mezintir) hate çareser kirin, da ku tespîtkirina rêziknameya berxwedana narkotîkê were çareser kirin. rasterast ji bo nimûneyên sputumê klînîkî tê sepandin.
Rêjeya tespîtkirina hilberê
34genên girêdayî berxwedana narkotîkê18dermanên dijî tîberkulozê û6Dermanên NTM hatin tesbîtkirin, nixumandin297cihên berxwedana narkotîkê;Deh cureyên Mycobacterium tuberculosis û zêdetir190cureyên NTM hatin dîtin.
Tablo 1: Agahdariya 18 + 6 Derman + 190 + NTM
sûd Product
Veguheztina klînîkî ya bihêz: Nimûneyên sputumê rasterast bi kargêrê xwe-liqufkirinê bêyî çandê têne kifş kirin.
Operasyona ceribandinê hêsan e: gera yekem a operasyona zêdekirinê hêsan e, û avakirina pirtûkxaneyê di 3 demjimêran de qediya, ku karbidestiya xebatê baştir dike.
Tîpkirin û berxwedana narkotîkê ya berfereh: Vegirtina cîhên tîpkirin û berxwedana narkotîkê yên MTB û NTM, ku xalên sereke yên xema klînîkî ne, tîpkirina rast û tespîtkirina berxwedana narkotîkê, piştgirîkirina nermalava analîza serbixwe, û çêkirina raporên analîzê bi yek klîk.
Lihevhatî: Lihevhatina hilberê, ku bi platformên sereke yên ILM û MGI / ONT ve girêdayî ye.
Taybetmendiya hilberê
| Koda hilberê | navê berhemê | Platforma Detection | taybetmendiyên |
| HWTS-NGS-T001 | Tîpkirina Mycobacterium û kîta tespîtkirina berxwedana narkotîkê (rêbaza zêdekirina piralî) | ONT, Illumina, MGI, Salus pro | 16/96rxn |
Dema şandinê: Jan-23-2024