Çareseriya teşhîsa TB û DR-TB ya şoreşger ji hêla #Macro & Micro-Test ve!

Çekekî Nû ji bo Tesbîtkirina Tûberkulozê û Tesbîtkirina Berxwedana Dermanan: Rêzkirina Armanckirî ya Nifşê Nû (tNGS) bi Fêrbûna Makîneyê re ji bo Tesbîtkirina Hesasiyeta Hesas a Tûberkulozê

Rapora wêjeyê: CCa: modelek teşhîsê ya li ser bingeha tNGS û fêrbûna makîneyê, ku ji bo kesên bi tuberkuloza bakterî û menenjîta tuberkulozê ya kêmtir guncaw e.

Sernavê tezê: Rêzkirina nifşê pêşerojê ya armanckirî li ser tuberkulozê û fêrbûna makîneyê: stratejiyeke teşhîsê ya ultra-hesas ji bo tubularên pişikê yên kêm û menenjîta tubular.

Demjimêr: 《Clinica Chimica Acta》

EGER: 6.5

Dîroka weşanê: Çile 2024

Macro & Micro-Test, bi hevkariya Akademiya Zanistên Çînê û Nexweşxaneya Singê ya Pekînê ya Zanîngeha Pizîşkî ya Paytextê, ​​modelek teşhîsa tûberkulozê li ser bingeha nifşa nû ya teknolojiya rêzkirina hedefgirtî (tNGS) û rêbaza fêrbûna makîneyê ava kir, ku hesasiyeta tespîtkirinê ya pir bilind ji bo tûberkulozê bi kêm bakterî û menenjîta tûberkuloz peyda kir, rêbazek nû ya teşhîsa hesasiyeta zêde ji bo teşhîsa klînîkî ya du celebên tûberkulozê peyda kir, û alîkariya teşhîsa rast, tespîtkirina berxwedana dermanan û dermankirina tûberkulozê kir. Di heman demê de, hat dîtin ku cfDNA ya plazmaya nexweş dikare wekî celebek nimûneya guncaw ji bo nimûneya klînîkî di teşhîsa TBM de were bikar anîn.

Di vê lêkolînê de, 227 nimûneyên plazmayê û nimûneyên şileya mêjî-hesinî ji bo avakirina du kohortên klînîkî hatin bikar anîn, ku tê de nimûneyên kohortên teşhîsa laboratîfê ji bo avakirina modela fêrbûna makîneyê ya teşhîsa tuberkulozê hatin bikar anîn, û nimûneyên kohortên teşhîsa klînîkî ji bo verastkirina modela teşhîsa damezrandî hatin bikar anîn. Hemû nimûne pêşî ji hêla hewzek probên girtinê yên armanckirî yên taybetî ji bo Mycobacterium tuberculosis ve hatin hedefgirtin. Dûv re, li ser bingeha daneyên rêzkirina TB-tNGS, modela dara biryarê ji bo pêkanîna pejirandina xaçerêyî ya 5-qatî li ser setên perwerde û pejirandinê yên rêza teşhîsa laboratîfê tê bikar anîn, û astên teşhîsê yên nimûneyên plazmayê û nimûneyên şileya mêjî-hesinî têne bidestxistin. Asta wergirtî ji bo tespîtkirinê têxe du setên ceribandinê yên rêza teşhîsa klînîkî, û performansa teşhîsê ya fêrbûyî bi xêza ROC tê nirxandin. Di dawiyê de, modela teşhîsa tuberkulozê hate bidestxistin.

Wêne 1 nexşeya şematîk a sêwirana lêkolînê

Encam: Li gorî nirxên taybetî yên nimûneya DNA ya CSF (AUC = 0.974) û nimûneya cfDNA ya plazmayê (AUC = 0.908) ku di vê lêkolînê de hatine destnîşankirin, di nav 227 nimûneyan de, hesasiyeta nimûneya CSF %97.01, taybetmendî %95.65, û hesasiyet û taybetmendiya nimûneya plazmayê %82.61 û %86.36 bû. Di analîza 44 nimûneyên cotkirî yên cfDNA ya plazmayê û DNA ya şileya mêjî ya ji nexweşên TBM de, stratejiya teşhîsê ya vê lêkolînê xwedî hevgirtinek bilind a %90.91 (40/44) di cfDNA ya plazmayê û DNA ya şileya mêjî ya ji nexweşên TBM de ye, û hesasiyet %95.45 (42/44) e. Di zarokên bi tuberkuloza pişikê de, stratejiya teşhîsê ya vê lêkolînê ji nimûneyên plazmayê re ji encamên tespîtkirina Xpert ên nimûneyên ava mîdeyê ji heman nexweşan hesastir e (%28.57 VS %15.38).

Wêne 2. Performansa analîzê ya modela teşhîsa tuberkulozê ji bo nimûneyên nifûsê

Wêne 3 Encamên teşhîsê yên nimûneyên cotkirî

Encam: Di vê lêkolînê de rêbazek teşhîsê ya hesasiyeta zêde ji bo tuberkulozê hate damezrandin, ku dikare amûrek teşhîsê bi hesasiyeta tespîtkirinê ya herî bilind ji bo nexweşên klînîkî yên bi tuberkuloza oligobacillary (çanda neyînî) peyda bike. Tesbîtkirina tuberkuloza hesasiyeta zêde li ser bingeha cfDNA ya plazmayê dikare ji bo teşhîsa tuberkuloza çalak û menenjîta tuberkuloz celebek nimûneyek guncaw be (nimûneyên plazmayê ji bo nexweşên ku guman li ser tuberkuloza mêjî heye hêsantir têne berhev kirin ji şilava mêjî-hesas).

Girêdana orîjînal: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s0009898123004990? bi rêya%3Dihub

Pêşgotineke kurt a berhemên tespîtkirina tuberkulozê yên rêzenivîsa Macro & Micro-Test

Ji ber rewşa nimûneyên tevlihev ên nexweşên tuberkulozê û pêdiviyên cûrbecûr, Macro & Micro-Test komek çareseriyên NGS-ê yên bêkêmasî peyda dike ji bo derxistina şilekirinê ji nimûneyên sputumê, avakirin û rêzkirina pirtûkxaneya Qualcomm, û analîzkirina daneyan. Berhem teşhîsa bilez a nexweşên tuberkulozê, tespîtkirina berxwedana dermanan a tuberkulozê, celebkirina mycobacterium tuberculosis û NTM, teşhîsa hesasiyeta zêde ya tuberkuloza bakterî-neyînî û kesên tuberkuloz, û hwd. vedihewîne.

Kitên tespîtkirina serial ji bo tuberkuloz û mîkobakteriyan:

Jimara heyber navê berhemê naveroka ceribandina hilberê cureyê nimûneyê modela guncaw
HWTS-3012 Nimûneya berdana ajanê Di dermankirina şilekirina nimûneyên balixê de tê bikar anîn, jimareya tomarê ya pola yekem, Sutong Machinery Equipment 20230047 bi dest xistiye. tîq
HWTS-NGS-P00021 Kîta tespîtkirina mîqdara Qualcomm ji bo tuberkuloza hesas a zêde (rêbaza girtina sondayê) Tesbîtkirina hesasiyeta zêde ya ne-dagirker (biyopsiya şile) ji bo tuberkuloza pişikê ya bakterî-neyînî û girêkên mêjî; Nimûneyên kesên ku guman tê kirin ku bi mîkobakteriyên tuberkuloz an ne-tuberkulozê vegirtî ne, bi rêbaza metagenomîk a rêzkirina kûr a bilind hatin analîzkirin, û agahdariya tespîtkirinê ya ka mîkobakteriyên tuberkuloz an ne-tuberkulozê vegirtî ne û agahdariya sereke ya berxwedana dermanan a xeta yekem a mîkobakteriya tuberkulozê hate peyda kirin. Xwîna perîferîk, şileya şuştina alveolê, hîdrotoraks û asît, nimûneya punksiyona fokusê, şileya mêjî-hesinî. Nifşa duyem
HWTS-NGS-T001 Kîta celebkirina Mycobacterium û tespîtkirina berxwedana dermanan (rêbaza rêzkirina amplîfîkasyona piralî) Testa tîpkirina Mycobacterium, tevî MTBC û 187 NTM;Tesbîtkirina berxwedana dermanan a Mycobacterium tuberculosis 13 derman û 16 cihên mutasyona bingehîn a genên berxwedana dermanan digire nav xwe. Tûk, şileya şuştina alveoler, hîdrotoraks û asît, nimûneya punksiyona fokusê, şileya mejî-hestînê. Platforma dualî ya nifşa duyemîn/sêyemîn

Xalên sereke: Kîta celebkirina mîkobakteriya HWTS-NGS-T001 û tespîtkirina berxwedana dermanan (rêbaza zêdekirina piralî)

Pêşgotina berhemê

Ev berhem li ser dermanên sereke yên rêza yekem û duyem ên ku di rêbernameyên dermankirina TB ya WHO de hatine vegotin, makrolîd û amînoglîkozîdên ku bi gelemperî di rêbernameyên dermankirina NTM de têne bikar anîn, hatiye çêkirin, û cihên berxwedana dermanan hemî komek cihên têkildarî berxwedana dermanan di kataloga mutasyona kompleksa Mycobacterium tuberculosis ya WHO de, û her weha genên berxwedana dermanan û cihên mutasyonê yên din ên hatine ragihandin li gorî lêkolîn û statîstîkên wêjeyên puanên bilind ên li hundur û derveyî welêt vedihewîne.

Nasnameya tîpkirinê li ser bingeha şaneyên NTM-ê yên ku di rêbernameyên NTM-ê yên ku ji hêla Kovara Çînî ya Tuberkuloz û Nexweşiyên Respiratorî ve hatine weşandin û lihevkirina pisporan de hatine kurtkirin e. Prîmerên tîpkirinê yên hatine sêwirandin dikarin zêdetirî 190 cureyên NTM-ê zêde bikin, rêz bikin û şîrove bikin.

Bi rêya teknolojiya amplîfîkasyona piralî ya PCR-ê ya hedefgirtî, genên genotîpkirinê û genên berxwedêr ên dermanan ên Mycobacterium bi PCR-a piralî hatin amplîfîkasyonkirin, û kombînasyona amplîkonê ya genên hedef ên ku werin tespîtkirin hate bidestxistin. Berhemên amplîfîkasyonkirî dikarin di pirtûkxaneyên rêzkirina bilind-derbasbûnê yên nifşa duyemîn an sêyemîn de werin çêkirin, û hemî platformên rêzkirina nifşa duyemîn û sêyemîn dikarin ji bo bidestxistina agahdariya rêza genên hedef ji rêzkirina kûrahiya bilind re werin derbas kirin. Bi berhevdana bi mutasyonên naskirî yên di databasa referansê ya çêkirî de (di nav de kataloga mutasyonê ya kompleksa Mycobacterium tuberculosis ya WHO û têkiliya wê bi berxwedana dermanan re), mutasyonên têkildarî berxwedana dermanan an hesasiyeta dermanên dijî-tuberkulozê hatin destnîşankirin. Bi hev re bi çareseriya dermankirina nimûneya sputumê ya xwe-vekirî ya Macro & Micro-Test, pirsgirêka bandora amplîfîkasyona asîda nukleîk a kêm a nimûneyên sputumê yên klînîkî (deh caran ji ya rêbazên kevneşopî bilindtir) hate çareser kirin, da ku tespîtkirina rêzkirina berxwedana dermanan rasterast li ser nimûneyên sputumê yên klînîkî were sepandin.

Rêzeya tespîtkirina hilberê

34genên têkildî berxwedana dermanan18dermanên dijî-tuberkulozê û6Dermanên NTM hatin dîtin, ku tê de297cihên berxwedana dermanan; Deh cureyên Mycobacterium tuberculosis û zêdetir ji190Hin cureyên NTM hatin dîtin.

Tabloya 1: Agahiyên 18+6 Dermanan +190+NTM

Avantaja berhemê

Lihevhatina klînîkî ya bihêz: nimûneyên balixê dikarin rasterast bi ajanek xwe-şilekirinê bêyî çandê werin tesbît kirin.

Operasyona ceribandinê hêsan e: dora yekem a operasyona amplîfîkasyonê hêsan e, û avakirina pirtûkxaneyê di 3 demjimêran de qediya, ku karîgeriya xebatê baştir dike.

Tîpkirin û berxwedana dermanan a berfireh: nixumandina cihên tîpkirin û berxwedana dermanan ên MTB û NTM, ku xalên sereke yên fikara klînîkî ne, tespîtkirina tîpkirin û berxwedana dermanan a rast, piştgirîkirina nermalava analîzê ya serbixwe, û çêkirina raporên analîzê bi yek klîk.

Lihevhatin: lihevhatina hilberê, adapteyî li platformên sereke yên ILM û MGI/ONT.

Taybetmendiyên hilberê

Koda berhemê navê berhemê Platforma tespîtkirinê taybetmendî
HWTS-NGS-T001 Kîta celebkirina Mycobacterium û tespîtkirina berxwedana dermanan (rêbaza amplîfîkasyona piralî) ONT, Illumina, MGI, Salus pro 16/96rxn

Dema weşandinê: 23ê rêbendana 2024an